鳄龟可以吃小鱼虾、蚯蚓、螺类、昆虫、黄粉虫、瘦肉、畜禽内脏、膨化饲料等食物，一般初春和初冬可每天喂一次，春末至深秋每天喂两次，喂食原则是定时、定量、定点，投下的食料以鳄龟在1.5小时内吃完为宜，避免污染水体。
鳄龟是杂食偏肉食的乌龟，人工饲养时可以准备多样化的食物，包括小鱼虾、蚯蚓、螺类、昆虫、黄粉虫和瘦肉、畜禽内脏、膨化饲料等，也可以搭配一些新鲜的蔬菜水果。
喂食鳄龟的时间可以根据季节变化来调整，一般情况下，初春和初冬时节可以每天中午投食一次，春末至深秋时节可以每天投食两次，分别在上午和傍晚。其中，上午可以少投一些，大概40%的量。
每天的投食需要定时定量，并且定点，固定在一处投放食物，投下的食料以鳄龟在一个半小时内吃完为好，吃不完的话下次注意少喂一些。
无论是否使用了过滤系统，食物残渣对水体的污染都是不可避免的，所以也需要时常换水，确保鳄龟能够在身心健康的环境下生长。
